Die Stiftung Parität Berlin wurde 2005 gegründet. Das Stiftungskapital stammt aus dem Anteilsverkauf des Paritätischen Unternehmensverbundes, jetzt Sana Berlin-Brandenburg. Der Vorstand ist ehrenamtlich tätig. Bei der Stiftung entstehen keine Verwaltungskosten, da die Förderprogramme über den Landesverband umgesetzt werden. Den Jahresabschluss 2019 prüfte die Wirtschaftsprüfungsgesellschaft MAZARS.

Zum fünfköpfigen Vorstand zählen Prof. Barbara John, Oswald Menninger, Dr. Ellis Huber, Dr. Gabriele Schlimper und Dirk Brandes. Die beiden erstgenannten bilden den geschäftsführenden Vorstand.